鱼组织器官的萎缩，原因大体上有三种，一是神经性萎缩，如花白鲢的疯子鱼，就是由于神经调节障碍，尾柄萎缩，正常情况下头长为尾柄高度的2.2至2.3倍，疯子鱼会在3倍以上。
二是营养不良造成的萎缩，当机体营养严重不足时，机体会消耗自身的肌肪和蛋白质来维持生命活动，从脂肪到肌肉，内脏器官肝、脾、肾再到心肌和大脑，逐步开始消耗萎缩。另外就是组只器官的血液输送受阻，营养不能通过血液管道进行运输，造成器官萎缩。
三就是用进废退，不常用的器官，失去了神经的刺激，器官的血液供应和代谢降低，营养不够产生萎缩。如有些深水鱼，眼睛对光感受退化，而嗅觉和听觉发达。
在肝萎缩中，有寄生虫或是细菌的炎症引发，也有微量元素及维生素缺乏引起，当看到肝脏手感变硬，边沿锐薄，体积缩小，重量减轻，有时还会伴随肠道的萎缩，肠壁变薄，轻轻一拉容易断。镜检时细胞体积缩小，胞浆致密，染色较深，胞核浓缩就可以确诊。萎缩的本质是机体的一种自我保护调节，以达到营养供给与消耗之间的平衡，所以在排出废用性萎缩，肝的萎缩只要把引发萎缩的因素消除掉，是可以治疗的。平时常见的就是补充维生素、胆碱和肝胆舒康，配合抗生素消炎。
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